Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim39Q9ESN2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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