Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn10Q9ESK3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms