Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms