Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D9D9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D9D9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D9D9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms