Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D4W2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D4W2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms