Protein–RNA interactions for Protein: Q9D035

Nkain1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain1Q9D035 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain1Q9D035 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkain1Q9D035 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms