Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih4Q9CX13 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms