Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdca4Q9CWM2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca4Q9CWM2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms