Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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