Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb3bpQ9CQ82 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms