Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpd52l3Q9CQ14 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms