Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtn4rQ99PI8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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