Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdca3Q99M54 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca3Q99M54 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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