Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3R4Q99570 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R4Q99570 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms