Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spdl1Q923A2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spdl1Q923A2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms