Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd49Q8VE42 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms