Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RttnQ8R4Y8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RttnQ8R4Y8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms