Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLX4Q8IY92 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLX4Q8IY92 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLX4Q8IY92 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLX4Q8IY92 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SLX4Q8IY92 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SLX4Q8IY92 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLX4Q8IY92 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLX4Q8IY92 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLX4Q8IY92 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms