Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap29Q8CGF1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms