Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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