Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ9

Prrg3, Transmembrane gamma-carboxyglutamic acid protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg3Q6PAQ9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrg3Q6PAQ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrg3Q6PAQ9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrg3Q6PAQ9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrg3Q6PAQ9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrg3Q6PAQ9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms