Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CcncQ62447 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms