Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd5Q5VCS6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms