Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms