Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms