Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms