Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC27Q2M243 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC27Q2M243 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms