Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B3Q16720 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2B3Q16720 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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