Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms