Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms