Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nbr1P97432 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms