Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms