Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms