Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tac1P41539 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tac1P41539 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 709.3 ms