Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkchP23298 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms