Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rag1P15919 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rag1P15919 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms