Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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