Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf13O54965 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf13O54965 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf13O54965 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf13O54965 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf13O54965 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf13O54965 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf13O54965 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf13O54965 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf13O54965 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf13O54965 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf13O54965 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf13O54965 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf13O54965 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf13O54965 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf13O54965 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf13O54965 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf13O54965 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf13O54965 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf13O54965 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf13O54965 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf13O54965 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf13O54965 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf13O54965 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf13O54965 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms