Protein–RNA interactions for Protein: O35181

Nrg3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrg3O35181 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nrg3O35181 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrg3O35181 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms