Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms