Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Farp1F8VPU2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms