Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms