Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd2E9PZM4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms