Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cped1B2RX70 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms