Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem238A9JSM3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms