Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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