Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms