Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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SKIV2LQ15477 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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SKIV2LQ15477 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SKIV2LQ15477 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SKIV2LQ15477 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SKIV2LQ15477 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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SKIV2LQ15477 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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SKIV2LQ15477 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SKIV2LQ15477 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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