Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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