Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NME3Q13232 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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